ФГБУ "НМИЦ им. В.А. Алмазова" Минздрава России
Малько В.А., Малкова А.М., Бисага Г.Н., Топузова М.П., Дрягина Н.В.,
Ефимцев А.Ю., Лепехина А.С., Дадацкий А.Ю., Щукина Т.В., Лукин М.В., Садовничук Е.А.
Малько В.А., Малкова А.М., Бисага Г.Н., Топузова М.П., Дрягина Н.В.,
Ефимцев А.Ю., Лепехина А.С., Дадацкий А.Ю., Щукина Т.В., Лукин М.В., Садовничук Е.А.
Узнать риск прогрессирования рассеянного склероза
Рассеянный склероз - распространенное аутоиммунное нейродегенеративное заболевание. Данный инструмент позволяет на основе клинических данных, оптической когерентной томографии сетчатки и магнитно-резонансной морфометрии рассчитать риск прогрессирования заболевания у конкретного пациента. Чтобы им воспользоваться, действуйте согласно инструкции ниже.
Инструкция
Теперь все процессы можно выполнять локально на своем диске
- Скопируйте файл шаблон и заполните в копии данные о пациенте
- Сохраните файл под необходимым именем
- Откройте Google Colab
- Через раздел Google Drive выберите файл ЗАПУСК.ipynb
Теперь Вы можете менять файл ЗАПУСК.ipynb локально на своем диске
Например: %cd /content/drive/MyDrive/мои_пациенты
!python3 predict_progression.py -model best_modelokt_clinic.h5 -pipeline best_pipeline_okt_clinic.joblib -p мой_пациент.xlsx
- В разделе Выбрать папку с файлами вместо многоточия впишите путь до вашей скопированной папки
Например: %cd /content/drive/MyDrive/мои_пациенты
- В разделе Запустить программу вместо pts.xlsx введите названия файла о пациенте
!python3 predict_progression.py -model best_modelokt_clinic.h5 -pipeline best_pipeline_okt_clinic.joblib -p мой_пациент.xlsx
- Перейдите в закладку Среда выполнения и выберите Выполнить все
- Программа автоматически запустится
- Вас попросят выбрать ваш Google account - следуйте инструкциям
- После того как программа завершит анализ, в разделе Тест программы появится решение алгоритма на основе тестовых данных:
pts_pro.xlsx - пациент с диагностированным вторично-прогрессирующим РС
- Информацию о Вашем пациенте можно будет найти в разделе Запустить программу в виде ответа "Есть вероятность прогрессирования" или "Нет вероятности прогрессирования"
